Archiwum Zakładowe przechowuje, z ustawowego obowiązku, dokumentację medyczną przez okres dwudziestu lat, licząc od końca roku kalendarzowego, w którym dokonano ostatniego wpisu, z wyjątkiem:
- Dokumentacji medycznej w przypadku zgonu pacjenta na skutek uszkodzenia ciała lub zatrucia, która jest przechowywana przez okres 30 lat, licząc od końca roku kalendarzowego, w którym nastąpił zgon.
- Skierowań na badania lub zleceń lekarza, które są przechowywane przez okres 5 lat, licząc od końca roku kalendarzowego, w którym udzielono świadczenia będącego przedmiotem skierowania lub zlecenia.
- Dokumentacji medycznej dotyczącej dzieci do ukończenia 2 roku życia, która jest przechowywana przez okres 22 lat.
Archiwum Zakładowe dysponuje ponadto bogatym zbiorem niemal dwustu tysięcy znacznie starszych pochodzeniem historii chorób, najstarsza zaś zachowana dokumentacja medyczna sięga swymi początkami połowy lat czterdziestych ubiegłego stulecia.